Ontology for Experimental Phenotypic Objects

L’Ontologie des Objets Phénotypiques Expérimentaux (OEPO) permet d’attribuer des types à des objets impliqués dans des expériences de phénotypage. Par exemple, l’organisation et le contexte de l’expérimentation, le type d’environnement, le matériel génétique utilisé, et les objets physiques étudiés. Elle définit également une hiérarchie de spécialisation entre ces objets en fonction des spécificités des installations et des expériences. Lire la suite

L’ontologie du noyer (Walnut Trait Ontology)


L’ontologie du noyer rassemble les traits et variables phénotypiques pour l’évaluation du noyer.

Ces caractères concernent la phénologie, la noix en coque et le cerneau. Ils proviennent des Descripteurs de la noix, IPGRI, 1994 ou ont été adaptés ou développés par Eric Germain.

Cette ontologie est utilisée dans le cadre d’essais de phénotypage menés à l’INRA de Bordeaux ainsi que sur les deux stations expérimentales de Creysse et de SENuRA, sur 150 accessions de noyer, entre 1965 et 2016. Ces données expérimentales ont été collectées dans l’objectif d’améliorer les connaissances pour mieux gérer les ressources génétiques. En outre, elles peuvent être utilisées pour des études phénologiques multi-site dans le contexte du changement climatique.

Focus métadonnée : « Designed for »

« Designed for » est un élément de métadonnées de la partie « Semantic resources » du formulaire de métadonnées de LovInra dans Data Inra.

Nous utilisons cette liste de valeurs définie dans le cadre d’OMV (Ontology Metadata Vocabulary for the Semantic Web)* et également utilisée dans AgroPortal. Pour vous aider à choisir la bonne valeur, nous vous proposons ici une traduction française de ses termes. Lire la suite

Focus métadonnée : « Nature of the semantic resource »

 » Nature of the semantic resource » est un élément de métadonnées de la partie « Semantic resources » du formulaire de métadonnées de LovInra dans Data Inra.

Nous utilisons cette liste de valeurs définie dans le cadre d’OMV (Ontology Metadata Vocabulary for the Semantic Web)* et également utilisée dans AgroPortal. Pour vous aider à choisir la bonne valeur, nous vous proposons ici une traduction française de ses termes. Lire la suite