Woody Plant Ontology

L’ontologie des plantes ligneuses (Woody Plant Ontology) énumère les variables de référence utilisées pour les expérimentations et les observations sur les plantes ligneuses (arbres et arbustes forestiers, et dans certains cas arbres fruitiers). Créée par l’URGI, elle est issue d’une initiative internationale basée sur différentes communautés (française, portugaise et européenne). Les termes sont recueillis auprès de diverses sources et organisés selon la norme Crop Ontology où chaque variable est composée d’un triplet :

  1. un caractère, le caractère étudié,
  2. une méthode, le protocole de mesure et
  3. une échelle, l’unité de mesure ou l’échelle de notation.

[image: ©Jean-Marie BOSSENNEC – Inra] Continuer la lecture

ANR D2KAB : Jobs et sujets de thèse en web sémantique

Dans le cadre du projet ANR D2KAB (Data to Knowledge in Agronomy and Biodiversity), dont l’INRA est partenaire, plusieurs postes sont ouverts dans le domaine du web sémantique au LIRMM à Montpellier, France: http://d2kab.strikingly.com/#positions

Deux postes (minimum 18 mois) pour travailler sur la plateforme AgroPortal, un portail d’ontologies et de vocabulaires en agronomie:

  • Ingénieur de recherche / développeur (web sémantique, service à base d‘ontologies)
  • Postdoc (gestion et alignement d’ontologies)

Deux sujets de thèses (entre autre ouverts au concours de l’école doctorale):

  • Doctorat (alignement d’ontologies et graphe de propriétés)
  • Doctorat (liage de données et enrichissement)

N’hésitez pas à nous contacter pour plus d’information. Les candidatures se font via le lien fourni.

Embarquez les métadonnées avec votre vocabulaire

https://rsnijders.info/vakblog/category/metadata/

Afficher les métadonnées dans un portail, c’est bien. Mais c’est encore mieux lorsqu’elles sont intégrées dans le fichier RDF de votre vocabulaire.

De cette façon :

  • les métadonnées peuvent s’afficher dans l’éditeur, e.g. Protégé, ou l’outil de visualisation (s’il le permet)
  • il est plus facile de conserver une cohérence à chaque nouvelle version: lorsque vous éditez le contenu du vocabulaire, vous pensez à mettre à jour les métadonnées
  • cela peut vous éviter de saisir plusieurs fois les métadonnées lorsque vous enregistrez votre vocabulaire dans des entrepôts et des catalogues. Pour cela,  l’entrepôt ou le catalogue doit être capable d’interpréter l’en-tête de votre fichier. Vos métadonnées doivent donc être exprimées selon un modèle standard, compris par le portail. C’est le cas pour les métadonnées proposées par Digitalist qui sont interopérables, autrement dit compatibles avec AgroPortal (malheureusement pas avec Data Inra).

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Groupe de travail RDA Agrisemantics : besoins et cas d’usage

Le groupe de travail Agrisemantics de la Research Data Alliance (RDA) vient de rendre public son second rapport intitulé « Uses and Needs of Semantic Resources in the Area of Agriculture ».

L’analyse des besoins de la communauté est issue de l’étude de 20 témoignages d’acteurs des domaines de l’agriculture et de l’alimentation qui mènent des activités nécessitant des ressources sémantiques. Elle a été complétée par un travail collectif lors d’un atelier qui s’est tenu à Berlin au printemps 2017 en marge de la 11ème plénière RDA. Continuer la lecture

Agri-Food Experiment Ontology (AFEO)

L’Agri-Food Experiment Ontology (AFEO) est une ontologie générique qui modélise la chaîne agro-alimentaire depuis la production de la biomasse jusqu’au produit fini, après transformation. Elle est le résultat de l’intégration et de l’extension de deux ontologies existantes, soit OAE (Agricultural Experiments Ontology) et OFPE (Ontology for Food Processing Experiment) également produites à l’Inra.

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